La qualité des cours d'eau
Vous souhaitez connaître la qualité des cours d'eau du Pays Basque, savoir comment ils sont suivis ou signaler une pollution ? Vous trouverez sur cette page toutes les informations pour vous guider.
Mise à jour : 19 mai 2025

Pourquoi protéger les cours d'eau ?
- La mauvaise qualité d’une rivière nuit à la vie de la biodiversité qui s’y déploie et peut, dans certains cas, provoquer la disparition des espèces les plus sensibles.
- La santé et la sécurité des personnes peuvent aussi être menacées. Au Pays Basque, l’eau brute utilisée pour produire l’eau potable provient pour un peu plus de la moitié (50 %) d’eau souterraine issue de 127 sources naturelles. Si la qualité devient trop mauvaise, il n’est plus possible de la rendre potable à un coût acceptable : la ressource doit être abandonnée.
Que dit la règlementation ?
La Directive Cadre Européenne sur l'eau (DCE) du 23 octobre 2000 fixe le cadre de la politique communautaire sur l’eau. L’objectif est d’atteindre le « bon état » des masses d'eaux, c’est-à-dire à la fois :
- Le bon état écologique (impact faible des activités humaines sur le fonctionnement des écosystèmes) ;
- Le bon état chimique (concentrations adéquates pour une liste de 45 substances prioritaires).
L'évaluation de la qualité d’un cours d’eau porte sur l’eau mais aussi sa faune, sa flore, ses habitats. Le bon état d’un cours d’eau requiert non seulement une bonne qualité de l’eau mais aussi un bon fonctionnement des milieux aquatiques, évalué à partir d’éléments de qualité biologique animaux (poissons, invertébrés) et végétaux (plantes aquatiques), physico-chimiques (phosphore, nitrate, pH) et hydromorphologiques (état des berges, continuité de la rivière, etc.).
Plusieurs lois françaises et leurs textes d’application y contribuent : lois sur l’eau (1964, 1992 et 2006), loi sur la pêche (1984), lois issues du Grenelle de l’environnement, etc. Ces différentes règles sont rassemblées dans plusieurs codes juridiques, notamment le Code de l’environnement.
Comment la qualité des cours d'eau est-elle suivie ?
Le Pays Basque compte 142 stations de mesure réparties sur l’ensemble des bassins versants (Côtiers basques, Nive, Bidouze, Saison et Adour aval et ses affluents). Les ⅔ du réseau (90 stations) est suivi en direct par la Communauté d'Agglomération Pays Basque. Le reste des stations est géré par l'Agence de l'eau Adour-Garonne. Si certaines données peuvent être acquises à l'aide de stations automatiques, beaucoup nécessitent une visite de terrain sur la station.
Différents acteurs sont ainsi mobilisés dans le cadre du dispositif de surveillance :
- Pour les données physico-chimiques / chimiques : Agences de l’eau et Offices de l’eau ;
- Pour les données d'hydrobiologie (faune et flore) : Agences de l’eau, DREAL/DRIEE, Office Français de la Biodiversité - OFB.
- Pour les données d'hydromorphologie : Agences de l’eau, Office Français de la Biodiversité - OFB.
Depuis sa création en 2017, la Communauté Pays Basque a plus que doublé le nombre de stations de mesure. En complément des mesures réglementaires, la Communauté Pays Basque a également pris l’initiative de suivre la qualité bactériologique (Escherichia coli et Entérocoques) ainsi que les résidus phytosanitaires (59 substances) de plus de 60% des stations.
Le référentiel des stations de mesure de la qualité des cours d’eau est accessible sur le site du Sandre.

Retardateurs de flamme dans la Nivelle : ce qu'il faut retenir
Suite à la mise en lumière fin 2023 de la présence de retardateurs de flamme dans le bassin de la Nivelle, la Communauté d’Agglomération Pays Basque a lancé avec l’Ifremer, l’IPREM (UPPA/CNRS) et l’ARS, une étude sur ces substances. Deux campagnes de prélèvements ont eu lieu en avril et septembre 2024 dans les eaux et sédiments de la Nivelle, la Bidassoa, plusieurs stations d’épuration et la prise d’eau de la Nive.
- Les concentrations mesurées sont faibles et ne justifient pas d’alerte sanitaire
- Les substances détectées sont des esters d’organophosphates, utilisés dans l’industrie (textile, électronique, etc.). On les retrouve facilement dans l’environnement (air, eau, poussières). Il n’existe actuellement aucun seuil réglementaire ou valeur sanitaire de référence, ni au niveau national, ni européen.
- À ce jour, aucun effet sanitaire avéré n’a été observé aux niveaux de contamination relevés dans le bassin de la Nivelle.
- Les autorités sanitaires (ARS) poursuivent la surveillance de l’eau potable sur plusieurs sites, dont la Nivelle. L’IPREM prépare actuellement un projet pour prolonger ces recherches, en intégrant notamment un volet sur les impacts potentiels sur la santé.
Comment connaître la qualité des cours d'eau ?
L’état des cours d’eau
Pour connaître en détail le niveau de qualité des cours d’eau du Pays Basque, vous pouvez consulter le site « Qualité rivière » développée par les Agences de l'eau. Il permet d'accéder au détail des données de chaque station de mesure. Un code couleur indique le niveau de qualité du cours d'eau.
- Bleu signifie que le cours d'eau est en très bon état ;
- Vert signifie que le cours d'eau est en bon état ;
- Jaune signifie que le cours d'eau est en état moyen ;
- Orange signifie que le cours d'eau est en état médiocre ;
- Rouge signifie que le cours d'eau est en mauvais état ;
- Gris signifie qu'il manque de données.
Sur les 5000 kilomètres de cours d'eau que compte le Pays Basque, 60% sont classés aujourd'hui en bon ou très bon état écologique.
L’état de conservation des espèces et des habitats
En parallèle de l’évaluation de l’état des cours d’eau, 2 directives dites « nature » (la directive « habitats-faune-flore » 92/43/EEC et la directive « oiseaux » 2009/147/EEC) évaluent l’état de conservation des espèces et habitats d’intérêt communautaire, c’est-à-dire les espèces et habitats considérés comme étant les plus vulnérables, menacés, rares ou endémiques, de l’Union européenne.
Les données d’inventaire d’espèces (dont les espèces aquatiques) sont accessibles sur le site de l’Inventaire National du Patrimoine Naturel.
Comment protéger les cours d'eau ?
La rivière est un milieu vivant aux équilibres naturels fragiles. Nos gestes quotidiens ont un impact direct sur la qualité de l'eau. Vous trouverez ici nos conseils pour protéger l'eau et la nature au Pays Basque.
Je signale une pollution
Si vous êtes témoin d'une pollution aquatique, vous pouvez alerter les services de la Communauté Pays Basque en remplissant le formulaire de signalement.
Questions fréquentes
La baignade en rivière est-elle autorisée ?
Pour savoir si vous pouvez vous baigner, vous pouvez télécharger l'application « Qualité rivière ». Elle est disponible gratuitement sur l'Apple Store et sur Google Playet recense toutes les informations des agences de l'eau.
Quels sont les risques d'une baignade en rivière ?
Le principal risque sanitaire lié aux proliférations de cyanobactéries réside dans la capacité de certaines espèces à produire des toxines (hépatotoxines, neurotoxines et dermatotoxines) pouvant provoquer des troubles de santé chez l’homme et les animaux.
Une même toxine peut être produite par des espèces différentes et une même espèce peut produire des toxines différentes. De plus, la quantité de toxine produite est très variable au sein d’une espèce et dépend des conditions environnementales.
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